1.肺部：肺癌、久咳不止、咳血、氣胸、肋膜積水、膿胸、肺結節、胸腔內各種良惡性腫瘤、氣管狹窄或異物進入氣管、縱膈腔腫瘤、縱膈腔炎、肺容積減量手術治療。

2.胸壁：胸部外傷、挫傷、胸骨、肋骨骨折、內出血(血胸)、胸壁腫瘤、雞胸、漏斗胸。

3.食道及胃：吞嚥困難、食物或胃酸逆流、食道癌、胃賁門癌、食道腫瘤、食道破裂、化學性食道灼傷、食道狹窄、逆流性食道炎、異物吞入食道、橫膈疝氣、腹腔鏡胃造廔與空腸造廔、腹腔鏡胃食道抗逆流手術。

4.胸腔鏡與腹腔內視鏡(微創)手術 (包括手汗症、狐臭、氣胸、血胸、良/惡性縱膈腔腫瘤、良/惡性肺腫瘤、良/惡性食道腫瘤切除與重建、重症肌無力症手術治療)。

5.介入性軟、硬式氣管鏡與食道鏡檢查及治療 (如氣管/食道支架置放術、雷射手術、冷凍治療手術、成人與小孩異物取出術、氣管狹窄處置)、非心因性胸痛、人工血管植入手術、氣管狹窄手術治療 (包括良、惡性腫瘤或發炎所引起、氣管軟化症)。